Каква е разликата между мотив и домейн в протеин?


Отговор 1:

Благодаря за A2A,

но мисля, че Ameya Dravid правилно отговори на вашия въпрос.

Така че, в основата си протеиновият мотив е свръхсекундна структура, състояща се от алфа спирала и / или бета лист и произволна намотка. Може да не е задължително да има биологични функции.

Но протеиновите домейни са триизмерни, структурирани върху / в протеин, който може да взаимодейства с други протеини / макромолекули / молекули и имат някои биологични функции. Например, транскрипционни фактори (TF) са група протеини, които имат „ДНК-свързващи домейни“. TFs седят върху промоторния или усилващия сегмент на ДНК, използвайки техния 'ДНК свързващ домен) преди / по време на синтеза на РНК от ДНК. Някои TFs имат домейн, който те се свързват с Major Groove of DNA, някои се свързват с Minor Groove.

Редактиране 1:

Мотивите не са независимо стабилни (не са стабилни извън протеина). Мотивите могат да бъдат части от домейни.

Домените са независимо стабилни.

Редактиране 2:

Ако мотивът може да има биологична функция, той може да бъде наречен домейн. Например: Мотивите на цинк-пръст са свързани със свързването на ДНК, така че те се наричат ​​също домейки на цинк-пръст.

И така, всички тези средства, Мотивите са структурна характеристика и Домените са функционални области на протеин.


Отговор 2:

Мотивът се дефинира като супер вторичната структура в един протеин. Те могат да бъдат толкова малки, колкото трипептид, проста амино последователност, които до голяма степен участват в някаква функционална роля на протеина. Примерите включват гръцки ключов мотив, мотив на цинков пръст, омега контур и т.н. Мотивите са предимно част от домейна, но обратното не е възможно.

Домените са структурно големи образувания и включват кватернерна структура на протеина. Това са независимо сгънати части от протеин, които могат да бъдат диференцирани както структурно, така и функционално. Като цяло те се считат за повтарящите се единици в големи протеини. Примерите включват бета барел, PDZ домейн, глобинова гънка, намираща се най-вече в имуноглобулини, кадхеринови повторения, открити в калциево зависимите протеини на адхезия.


Отговор 3:

Протеиновият мотив е свръхсекундна структура, съдържаща множество вторични структури в стабилно разположение и обикновено се намира в други протеини, като не е задължително да има сходство по функция.

например: Омега контурът е протеинов мотив с всякаква аминокиселинна последователност, като единственото условие е да може да образува стабилна структура, наподобяваща гръцката буква омега. Това прави мотива изключително често срещан, но нищо не може да се каже за неговото значение във функцията на протеина.

Обратно на това, протеиновият домен е стабилна структура със специфична, определена функция в протеина и може да съществува независимо от протеина, т.е. може да поддържа структурата си, дори ако е отделен от протеина.

например: SH2 (src хомология 2) домейни се намират в сигнални пътища в пътя JAK-STAT, които са отговорни за контролирането на транскрипцията на определени гени. Функцията на този домен е да свързва протеина, съдържащ този домейн, към специфични места в мембранния протеин.